KEGG Аннотация

голоса
-2

У меня есть набор генов (аминокислотные последовательности). Я хочу найти функциональные аннотации на основе KEGG или KO идентификаторы. Есть ли база данных KEGG доступны для скачивания? Я хочу использовать взрыв с этой базой данных. Кроме того, я искал R пакет, который может помочь мне в этом отношении.

Надеюсь, так что я разъяснил мой запрос. Спасибо за ответ заранее.

Задан 19/09/2018 в 12:59
источник пользователем
На других языках...                            


1 ответов

голоса
0

KEGG базы данных требуется подписка:

https://www.bioinformatics.jp/en/keggftp.html

Прайс-лист:

https://www.bioinformatics.jp/docs/subscription_schedule.pdf

Если вы по-прежнему заинтересованы здесь список доступных данных:

https://www.kegg.jp/kegg/download/

FASTA последовательности здесь:

https://www.kegg.jp/kegg/download/Readme/README.fasta

Ответил 19/09/2018 в 13:30
источник пользователем

Cookies help us deliver our services. By using our services, you agree to our use of cookies. Learn more